サイトからダウンロードでもいいのですが、Visual Studio 2017をインストールしたときにインストールされるVisual Studio Installerを立ち上げるとUpdate 3の更新を求められるので、サクッと更新してから画面上の[変更]ボタンを押して各種必要なものをUpdate 3に置き換えていくのがいいでしょう。
とはいえ、UnityとかはUpdate 3よりも更新が進んでいるので、必要に応じて、Visual Studio Installerからインストールした後に、プログラムの追加と削除からUnityをアンインストールしてUnityのサイトからUnity 2017をダウンロードしてインストールしてあげるといいでしょう。